236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3838 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 195 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  53.01 
 
 		 183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  42.69 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  38.04 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  41.9 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  18.83 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.76 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  26.13 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  36.59 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  35.38 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>