224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2464 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  366  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  51.49 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  42.54 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 232 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 243 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  38.55 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 226 aa  87.8  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  40.72 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  41.67 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  38.56 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  37.75 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.13 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  29.59 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  33.52 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.44 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>