69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3021 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  29.29 
 
 		 196 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  29.95 
 
 		 199 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  30.21 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  31.34 
 
 		 196 aa  89  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  29.78 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  27.87 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  27.87 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  27.12 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  28.35 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 193 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  22.56 
 
 		 201 aa  42  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 208 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>