77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01438 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  91.33 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  72.96 
 
 		 196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  57.65 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 203 aa  131  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  37.11 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 221 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 226 aa  92  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  26.56 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  26.56 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  28.06 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  25.77 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 248 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  20.47 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  22.89 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 307 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  24.87 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 333 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 200 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  24.14 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  23.6 
 
 		 221 aa  41.2  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 295 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>