86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004024 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  91.33 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  75 
 
 		 196 aa  313  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  56.63 
 
 		 199 aa  241  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  37.76 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  27.23 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  26.56 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  26.56 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  26.55 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  25.83 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  19.3 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  20.69 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  22.4 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  22.84 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  21.37 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  24.19 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  22.28 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  19.77 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 333 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 186 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 203 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 226 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  20.23 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>