90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1142 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  60.21 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  55.08 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  49.21 
 
 		 190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  50.53 
 
 		 190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  52.88 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  52.41 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  49.47 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  43.9 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  39.04 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  39.08 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  30.43 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 183 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  35.92 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  35.92 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  35.92 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  35.79 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  36.36 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  30.49 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  24.41 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 211 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.41 
 
 		 190 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 224 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 393 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>