183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1344 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  32.39 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  24.54 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  37.1 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  30.97 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.81 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  30.97 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  29.22 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.34 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2659  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144734  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  37.74 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 264 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  32.53 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>