178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3147 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  100 
 
 		 183 aa  357  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  45.2 
 
 		 202 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  33.52 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  42.29 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  35.19 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  38.37 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  87.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  38.89 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  31.71 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  30.41 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 222 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 234 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.41 
 
 		 228 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  30.05 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 244 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 255 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 295 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  32.14 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  24.43 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 236 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 247 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 239 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 343 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 247 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 247 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 233 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>