191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3167 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  66.81 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  64.91 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 217 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 217 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 217 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  55.35 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  48.9 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 278 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  46.97 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  41.7 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  44.88 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  40.81 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  46.53 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  42.34 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  43.22 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  37 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 195 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  35.79 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  29.9 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  27.87 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  30.45 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  24.76 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>