117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2788 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  66.84 
 
 		 195 aa  248  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  50.53 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  41.18 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  40.84 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  36.9 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  40.66 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  41.15 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  39.57 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  30.65 
 
 		 185 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  30.27 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  30.27 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 182 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  39.01 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 256 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 263 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  57.45 
 
 		 310 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 238 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  34.55 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  31.37 
 
 		 260 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 285 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 343 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 281 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 250 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  47.17 
 
 		 256 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 315 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  33 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 242 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 330 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>