114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4831 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  93.51 
 
 		 185 aa  350  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  92.97 
 
 		 185 aa  349  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  91.35 
 
 		 185 aa  343  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  93.89 
 
 		 182 aa  342  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  93.37 
 
 		 182 aa  341  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  93.33 
 
 		 182 aa  340  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  92.22 
 
 		 182 aa  337  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  92.22 
 
 		 182 aa  337  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  33.52 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  34.16 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  32.46 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  31.32 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  31.45 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 212 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 212 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 212 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 218 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  37.74 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  29.26 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  35.67 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  29.94 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.96 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 218 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.28 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  28.77 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.25 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 209 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 343 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  27.18 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 253 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 315 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 295 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 255 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>