54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1480 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  89.47 
 
 		 190 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  64.71 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  55.32 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  54.5 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  52.66 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  42.94 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  32.92 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  34.76 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  35.19 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 285 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.72 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  34.74 
 
 		 228 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  26.44 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 256 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 194 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  24.85 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 250 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 216 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 283 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>