89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2085 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  50.53 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  49.74 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  34.76 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  37.85 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  38.22 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 183 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  28.72 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  37.97 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  37.1 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  28.25 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 410 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 255 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 259 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.05 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 319 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 451 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 451 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 428 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 272 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 262 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  27.85 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 408 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 424 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  29.07 
 
 		 239 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 255 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  35.92 
 
 		 225 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  35.92 
 
 		 225 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  35.92 
 
 		 225 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 197 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  44 
 
 		 233 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 246 aa  41.6  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>