50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5854 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  89.47 
 
 		 190 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  65.61 
 
 		 189 aa  236  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  59.26 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  55.61 
 
 		 189 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  50.53 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  55.32 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  49.48 
 
 		 205 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  45.4 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  30.19 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.23 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 304 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  32.65 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  24.12 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 250 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 283 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 295 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  29.63 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>