55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0927 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  46.49 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  44.28 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  38.5 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  29.47 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  36.87 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  35.45 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  34.24 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  29.17 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  32.86 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  32.98 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  35.52 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  27.69 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  31.87 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  21.38 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.71 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.16 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 211 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 196 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  24.71 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>