181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0983 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  85.95 
 
 
191 aa  330  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  82.35 
 
 
192 aa  329  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  77.62 
 
 
218 aa  329  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  33.76 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
182 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 
182 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
185 aa  94.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  31.07 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  33.12 
 
 
182 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  33.12 
 
 
182 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  33.12 
 
 
182 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  33.96 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  33.94 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  32.64 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  30.91 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  32.92 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  30.6 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  31.91 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  32.32 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
268 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.75 
 
 
203 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
184 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
285 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  42.86 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
319 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
315 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 
195 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  47.46 
 
 
343 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  33.61 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 
261 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.24 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  32.82 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
253 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
242 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  40.91 
 
 
235 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
271 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
249 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  21.64 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.04 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 
272 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
231 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  27.44 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  27.44 
 
 
208 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 
196 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>