More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3892 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  48.29 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 255 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  36.81 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 246 aa  85.1  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  42.52 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 258 aa  72  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  31.53 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  49.3 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  36.13 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  34.21 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  30.57 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.61 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  32.41 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>