226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1460 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  32.79 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  33.2 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  34.05 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  43.58 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 238 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 315 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.17 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 343 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 330 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.33 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  29.83 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 310 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  42.31 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.69 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  24.03 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  31.65 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>