More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4458 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 263 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  49.55 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  50.92 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  51.63 
 
 		 221 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  50.47 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  45.91 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  52.56 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  32.3 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 315 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 225 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 244 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 242 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 210 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 343 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 343 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 304 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31.9 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  40.12 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 311 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  34.93 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  36.74 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.43 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  30.3 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  42.52 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  30.38 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  30.38 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  30.38 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>