299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0040 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  40.76 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 240 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  33.05 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.73 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  29.87 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  29.79 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  26.1 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.57 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 343 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  28.36 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  29.08 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  24.89 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.17 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  30.23 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 315 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 244 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>