More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4050 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  55.61 
 
 		 222 aa  252  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  57 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 228 aa  235  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  48.6 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  51.21 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  51.63 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  45.93 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  33.03 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 249 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  29.77 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  35.86 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  32.11 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  35.81 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  36.11 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.6 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  30.14 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  30.14 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  30.14 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  34.75 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>