More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2637 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  36.1 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  36.1 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  36.1 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  35.07 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  36.45 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 223 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  38.93 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  30.81 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  27.6 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.34 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  32.16 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>