205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2727 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  36.95 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 315 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  31.8 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 234 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  30.45 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  29.72 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  32.49 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  31.02 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.62 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.41 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 330 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  31.29 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  29 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.91 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  31.51 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  30.68 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>