More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2792 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 190 aa  274  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 192 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 192 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 192 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  49 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 216 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  39.36 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 249 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  32.18 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  32.18 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  32.18 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  52.38 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  31.98 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  34.01 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 229 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.91 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  37.35 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  37.39 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  20.24 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 267 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 272 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.05 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 343 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 250 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 231 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>