294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  49 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 185 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  40.69 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  45.22 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  37.32 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  43.15 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  34.91 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  34.91 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  34.91 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  33.18 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  63.16 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 239 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 173 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  37.93 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 283 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>