More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4572 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
223 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  43.87 
 
 
220 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 
239 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
226 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  37.33 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
285 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 
343 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.51 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2589  regulatory protein TetR  44.17 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  26.91 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 
315 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  37.89 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
315 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  37.88 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  32.09 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  32.65 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  47.89 
 
 
199 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  24.66 
 
 
247 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 
283 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
253 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  35.51 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.191465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>