More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3932 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  80.19 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  60.39 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  53.55 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  49.53 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 268 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 272 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 315 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 253 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  33.18 
 
 		 190 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  29.33 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.67 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  27.73 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.38 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  23.99 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.52 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  30.86 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  31.25 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  31.25 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>