More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3300 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  80.19 
 
 		 228 aa  339  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 223 aa  227  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  53.14 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  49.05 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  51.66 
 
 		 263 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  43.23 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 250 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 244 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 244 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 249 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 315 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.98 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 304 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.7 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.72 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  36.18 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 343 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  39.86 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 183 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  42.06 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  29.28 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 264 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31.08 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  34.46 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  35.34 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  31.75 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>