188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7747 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  41.82 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 253 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  38.7 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  41.23 
 
 		 272 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  34.16 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 259 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 248 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 269 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 230 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  32.43 
 
 		 247 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 226 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 238 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  29.96 
 
 		 266 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 268 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 272 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 255 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 224 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 221 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  45.87 
 
 		 239 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 224 aa  85.9  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  52.22 
 
 		 228 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  34.51 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  35.21 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.33 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  31.25 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  40.6 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  28.7 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 267 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  44 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  32.02 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>