243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1527 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 263 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  36.33 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  36.73 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  34.15 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.47 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 315 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  30.45 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 223 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  33.2 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  27.82 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  32.64 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.24 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.61 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  35.94 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  36.81 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>