135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5781 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  36.27 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  73.33 
 
 		 1021 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  38.13 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  34.13 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  35.35 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  37.67 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  30.81 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  30.4 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  36.45 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  30.73 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.03 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  28.83 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6620  tetracycline repressor domain-containing protein  32.41 
 
 		 165 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 343 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 281 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>