More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3718 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  48.87 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  48.6 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  46.01 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.96 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 249 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  32.44 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 311 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 304 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  27.15 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 248 aa  85.1  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 250 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  29.86 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  32.47 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  36.91 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  32.66 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  30.81 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  26.73 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  30.92 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 315 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>