281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1499 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  52.82 
 
 		 245 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  43.36 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 242 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  36.74 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.47 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 226 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 238 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 210 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 223 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  33.49 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  27.43 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  27.78 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  29.2 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  30.84 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  28.88 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  26.25 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.17 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>