218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3817 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  32.84 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  34.01 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.01 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  31.85 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  36.15 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  31.02 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  29.44 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  39.29 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  28.89 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>