115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3353 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  27.03 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 241 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 271 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  36.51 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  31.63 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 315 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 259 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 250 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  29.75 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 285 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  32.08 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  25 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.77 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 261 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2589  regulatory protein TetR  43.55 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  21.24 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>