194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0631 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  99.53 
 
 
215 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  99.53 
 
 
215 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
215 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  94.88 
 
 
215 aa  390  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  91.16 
 
 
215 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  91.16 
 
 
215 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  81.99 
 
 
223 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  50.48 
 
 
223 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.9 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
259 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  33.86 
 
 
230 aa  61.6  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 
248 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  29.38 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
244 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
244 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
244 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.16 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
315 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  29.22 
 
 
219 aa  55.1  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  26.57 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  26.57 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  26.57 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 
195 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.69 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  29.81 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  22.71 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  31.71 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 
262 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
199 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>