79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3334 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  28.08 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 238 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  26.79 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 343 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 250 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 235 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 253 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  29.29 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  25.58 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 253 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  23.14 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  32.05 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 265 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 239 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 241 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1322  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 230 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  26.5 
 
 		 247 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>