289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1048 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  42.99 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  41.15 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.9 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2990  hypothetical protein  50.68 
 
 		 107 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  23.85 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  36 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  34.73 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 343 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  26.67 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  29.17 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  26.18 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>