272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0716 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  82.33 
 
 		 233 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 257 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  53.92 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  44.02 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  46.92 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 268 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  36.71 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 343 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  42.61 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  34.16 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  30.36 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  42.22 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  34.44 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  27.85 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  30.53 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.25 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  27.75 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  25.76 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  25.76 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  25.76 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.56 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  28.32 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.77 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  28.14 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>