252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0683 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  82.33 
 
 		 231 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  82.63 
 
 		 257 aa  354  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  45.02 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  34.71 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.09 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 342 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  35.97 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  34.55 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  32 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  42.24 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  33.56 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  29.03 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  28.7 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  26.5 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  26.5 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  26.5 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>