244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0801 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  61.4 
 
 
230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  52.65 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  36.12 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 
253 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
229 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 
255 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 
241 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 
283 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 
272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
242 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 
311 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
293 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  32.48 
 
 
262 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
223 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
268 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 
272 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
255 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 
304 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
265 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
248 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
272 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
247 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
271 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 
342 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
253 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
235 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.03 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  36.91 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
269 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
315 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 
283 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
330 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 
263 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 
264 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 
222 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 
247 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  39.63 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.28 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.74 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 
343 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 
252 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  29.63 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>