292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0017 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  51.21 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  49.05 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  46.08 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  35.55 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 253 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 233 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 240 aa  98.6  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 268 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 315 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 272 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 342 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  30.88 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.81 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  36.21 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  31.92 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  29.68 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 304 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  30.66 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.01 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>