More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2357 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
218 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  54.25 
 
 
224 aa  218  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  50.24 
 
 
228 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  46.01 
 
 
223 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  45.93 
 
 
221 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 
214 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 
224 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 
263 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
250 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
229 aa  111  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 
211 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  33.49 
 
 
247 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
249 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 
249 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 
210 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 
240 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 
218 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.95 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
242 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
234 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
253 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
230 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
253 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 
343 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 
311 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 
315 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  38.57 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 
272 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
257 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.13 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
268 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 
283 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
315 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 
304 aa  85.1  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
293 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 
252 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
247 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
242 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  41.67 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
271 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  29.65 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  31.8 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  30.66 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  35.92 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>