241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3884 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 304 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  40.25 
 
 		 255 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 253 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  40.25 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  36.1 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  35.41 
 
 		 239 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  34.76 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.78 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 255 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 226 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  33.61 
 
 		 256 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  35.02 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  44.06 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 252 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  52.56 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  26.92 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  35 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  23.88 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>