More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2273 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  61.79 
 
 		 222 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  60.39 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  57 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 		 223 aa  224  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  54.25 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  50.46 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 248 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.44 
 
 		 272 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.82 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  30.91 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 183 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  32.13 
 
 		 342 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  28.5 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31.19 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  34.97 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  33.33 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 249 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 343 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  30.82 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  32.03 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>