199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9231 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  50.89 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 311 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 293 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  42.54 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  33.47 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.81 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  32.02 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.56 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  32.47 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.95 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  36.57 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.99 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.68 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>