More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0819 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  44.08 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1975  tetracyclin repressor-like  47.66 
 
 		 111 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 210 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  32.73 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  29.23 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>