123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6425 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.65 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  28.91 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 343 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 218 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 304 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  30.65 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  28.86 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  39.19 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  24.53 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  29.84 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  32.24 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  30.56 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  29.84 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  28.31 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.77 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  26.48 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 211 aa  45.4  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  31.25 
 
 		 230 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5281  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  43.55 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  33.64 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>