More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2585 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 271 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.09 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  29.44 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  36.03 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  30.49 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  32.81 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  30.83 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  32.58 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3334  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  27.72 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  33.08 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.13 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  34.75 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  26.57 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  29.56 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  28.47 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  34.29 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  31.01 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.9 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>