199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4679 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  31.94 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.46 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  35.61 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  31.69 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  44.29 
 
 		 343 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 271 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 304 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 272 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  29.51 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  29.2 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  29.93 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  30 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.71 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  25 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  41.79 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>